碇真嗣(碇シンジ，Ikari Shinji，声优：绪方惠美) (又译碇真治)
年龄：14岁。是EVA初号机的驾驶员，第3适格者，心灵有创伤的自闭少年。
他自小被父亲寄养在亲戚家中，十多年来与父亲极少来往，这使他在年幼时就已非常独立，但这同时也是构成他心灵创伤的原因之一。
作为驾驶员，他与EVA初号机的同步率最高，在歼灭使徒的各次战役中的表现亦最为突出。他是一个性格相当温和而内向的少年，处事态度消极、遇事总是用“对不起”来逃避现实。作为本片的主人公，片中有很多对其心理的描写，包括多次他的回忆、和自己的对话中都能够体现他的性格。他宁愿选择让别人伤害自己，也不愿去伤害别人，而在更多的时候却选择了逃避(有很多集着重写了他逃离NERV，逃避自己命运的剧情)。
后来由于“活宝二人组”的带动及明日香的出现，变得比较开朗活泼一些。平时对做家事相当拿手，在他寄居于葛城美里住处时，几乎都是靠他来操持家务。
可能很多看过的人会觉得作为主人公的他显得十分懦弱和无能，但事实上这是有原因的，是由于幼时被母亲碇唯特别安排来到现场亲眼看到母亲由于同步率400%而以量子态被溶于LCL中，拯救计划失败，故内心有很深的创伤，虽然他忘记了，但潜意识已经受到创伤(因为真嗣并不知情，以为母亲“死了”，事实上她将自己的灵魂移转到EVA初号机，依照漫画版的设定，她是自愿留在初号机中的)。
虽然他有懦弱无能的形象，但实际上他的战绩一流，也有几次非常勇猛的表现，而且他在经历数次剧痛后，战斗意识还更强烈，对于创伤及压力的忍受力算是非常好的;许多军人在类似的状况，也会崩溃。相较于许多作品中，抗压力超过人类极限的英雄，他的反应更类似正常人的反应。
事实上他在与第十使徒(力天使塞路尔(Zeruel))的较量中也被溶解于LCL中，在赤木律子博士和葛城上尉的努力下，身体才得以重新实体化。
在漫画版中，他最后把初号机当成妈妈，他最终也知道碇唯的灵魂留在初号机里面;在电视版中，他也感觉到初号机跟妈妈的关系。
本名：碇シンジ
(Ikari：Shinji)
别号：第三适格者、碇真治、碇信志、小狗君
发色：黑发
瞳色：藏蓝瞳
身高：157cm
年龄：14岁—28岁(Q中)
生日：6月6号
血型：A型
声优：绪方惠美
神木隆之介(成年期)
萌点：早熟、弱气、坏掉、家务全能、优柔寡断、机郎、大提琴、紧身衣、机器人驾驶员、随身听、旱鸭子、自慰
出身地区：日本第三东京市
所属团体：NERV、第三新东京市立第一中学2年A组
监护人：葛城美里
母亲：碇唯
父亲：碇源堂
碇真嗣，年龄14岁，是EVA初号机的驾驶员，第三适格者(THIRD：CHILDREN)。幼年时亲眼目睹了母亲碇唯在试验事故中被"消灭"，其父碇源堂在失去妻子之后将其寄养在亲戚家中，不幸的童年经历致使了其内向而不自信、渴望得到他人(尤其是父亲)的认可的性格。突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。在14岁时被10年以来久无音讯的父亲碇源堂叫到第三新东京市，本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“使徒”的巨大生物与军队交火。
危急之下，特务机关NERV的成员葛城美里将真嗣救下，并将其带往碇源堂所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是父亲冷酷的命令：驾驶称为“EVA”的巨大人形生物兵器与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到父亲命令受重伤的零号机驾驶员绫波丽强行代之出战后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
不断袭来的使徒，身份不明的绫波丽，从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格雷，打破心之壁垒的异族美少年渚薰，14岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇源堂不动声色地观察一切，一个被他称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划逐渐浮出水面。
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