《拳皇'99 千年之战》（英语：The King of Fighters '99: Millennium Battle）是SNK开发的格斗游戏，也是拳皇系列的第六作。本作最初在1999年于日本登陆Neo Geo的街机系统。
（KOF99 NEOGEO版封面。故事开启新篇章。新系统新人物。主角换成了K'，系统由传统的三人组队变为四人，加入援护系统。）
系列中首创以第四名队员为战斗中援助角色的“Striker”系统，此系统争议颇大。本作起主角更换成丧失记忆的白发少年K'（K Dash）。本作是继首作的拳皇94后，第二次最终头目战须连战两场。
故事剧情
本作开始，拳皇系列进入称为“音巢篇”的新故事主线。主角为被组织NESTS改造并植入了草薙家火焰作实验，失去了所有记忆的K（K Dash）。这个神秘组织不断进行人体改造实验及捕获了草薙京进行生化克隆人实验，其好友红丸及真吾发现草薙京失踪与NESTS有关决定参赛找寻京，而八神庵亦秘密暗地里找寻草薙京，故事在此于展开。
主角K为了追寻自己的过去，决定背叛组织并参加组织举办的拳皇大赛，他与一同背叛组织的麦克斯（Maxima）及找寻失踪了的草薙京的两人二阶堂红丸及矢吹真吾组成队伍参赛。故事后段，他们击败了组织高层成员古利查力度（Krizalid）知道更多组织隐情，基地爆炸众人及时逃生，古力查力度生死不明。
（KOF99 索尼PS版封面，于2000年三月份发售）
出场人物
《主人公队》K'（K DASH）麦斯玛（MAXIMA）二阶堂红丸（BENIMARU NIKADO）矢吹真吾（SHINGO YABUKI）
《饿狼传说队》泰瑞·柏格（TERRY BOGARD）安迪·柏格（ANDY BOGARD）东丈（JOE HIGASHI）不知火舞（MAI SHIRANUI）
《龙虎之拳队》坂崎良（RYO SAKAZAKI）罗伯特·卡西亚（ROBERT GARCIA）坂崎百合（YURI SAKAZAKI）坂崎琢磨（TAKUMA SAKAZAKI）
《専用人物》草薙京1（KYO-1）草薙京2（KYO-2）《怒队蕾欧娜》（LEONA HEIDERN）拉尔夫（RALF JONES）克拉克（CLARK STEEL）葳璞（WHIP）
《超能力战士队》麻宫雅典娜（ATHENA ASAMIYA）椎拳崇（SIE KENSOU）镇元斋（CHIN GENTSAI）包（BAO）
《女性格斗家队》琼（KING）布鲁．玛莉（BLUE MARY）藤堂香澄（KASUMI TODOH）李香绯（XIANGFEI LEE）
《韩国队》金卡法 （KIM KAPHWAN）陈可汉（CHANG KOEHAN）邱丰凯（CHOI BOUNGE）全勋（JHUN HOON）
《最终BOSS》古利查力度（KRIZALID）
《额外BOSS》八神庵（IORI YAGAMI） （条件）《额外BOSS》草薙京（KYO KUSANAGI） （条件）
《隠藏人物》草薙京（KYO KUSANAGI）八神庵（IORI YAGAMI）以下为《拳皇'99 进化》版本 追加改动(登场)
《专用人物》草薙京（KYO KUSANAGI）八神庵（IORI YAGAMI）草薙京1（KYO-1）草薙京2（KYO-2）
《追加人物》古利查力度（KRIZALID）
《额外援助》赛斯（SETH）、凡妮莎（VANESSA）、大门五郎（GORO DAIMON）、比利·凯恩（BILLY KANE）山崎龙二（RYUJI YAMAZAKI）、校服版草薙京（KYO SP）、神楽千鹤（CHIZURU KAGURA）校服版雅典娜（ATHENA SP）、艾尔弗（Alfred Airhawk）、菲雅（FIO GERMI）
由于98已经将原来的路走到了极致，为了再上台阶，SNK大胆改变基本操作系统，将原来的侧身闪避和紧急回避结合成闪避移动，并且在闪避过程中可以出招，进一步加大了系统的攻击性。此外爆发方式改成了攻击模式(COUNTER MODE)和装甲模式(ARMOR MODE)，视实际情况可以自行选择，要消耗全部三颗能量豆。护援系统的出现，使战斗变得更加扑朔迷离。适当运用护援，防守更如铁壁，进攻更似尖刀，将原本与自己实力相当的对手一挑三也不在话下。
可下载模拟器游玩。
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